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实操指南 | 双侧标准化图怎么用?

112 人阅读发布时间:2025-09-04 09:17

双侧标准化图是一种将连续的,定量的输入连续映射的图形。可以用于展示功能term显著性、基因表达情况、或基因的上下调趋势等。

 

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登录和元生信云平台【元分析】选择“双侧标准化图”,开始啦~

 

1.数据准备

上传“数据矩阵”,如下。第一列为名称,第二列为相关指标或对应数值。

 

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2.调整“绘图参数”

①数据参数

类型:lollipop 表示中轴线两侧绘制滑珠图;bar 表示中轴线两侧绘制条形图;

线条大小:随着右拉数值增大,从纵轴延伸出去的红蓝线增粗;

点大小:随着右拉数值增大,红蓝线终点处定位横纵数值的点变大;

标准化:打开是将数据进行标准化后,显示在±2的比例尺上;关闭则显示纵向滑珠图和柱状图;

颜色:表示线条颜色,默认红色为正向线条颜色,蓝色为负向线条颜色。

②通用参数

标题:自定义绘图标题,支持中英文;

输出格式:选择输出文件的格式,其中pdf、svg、eps为矢量图格式,jpeg、png、tiff为位图格式,pptx可用于自主修改绘图中的文字、颜色等元素,plotly为html动态网页格式;

宽度、高度:定义绘图的长宽,若输出图形元素过于密集,则可适当调整该参数;

主题:可选择ggplot主题包ggthemes中提供的主题,美化绘图。

 

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提交数据:等待运行结果,分析结果将会在左侧呈现。

 

3.下载

下载所需数据,完成作图啦

 

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和元多组学服务

和元生物提供多组学服务(如转录组、Astral蛋白组、代谢组、微生物组、Cut&Tag、MeRIP (m6A)-seq、WGBS、RRBS等)和单细胞及空间转录组服务(如10x单细胞转录组、10x单细胞转录组及TCR/BCR、墨卓单细胞转录组、DNBelab C-TaiM4单细胞转录组、CytAssist空间转录组、HD空间转录组、Stereo-seq 空间转录组等),致力于为广大生命科学家、医学工作者提供基于多组学的科研及临床应用解决方案。累计协助客户在Advanced Science、Journal of Nanobiotechnology、Advanced Functional Materials、ACS Nano、Nature Aging、Neuron等期刊发表SCI论文,并推出了广受好评的生信分析云平台,助您高效实现个性化数据挖掘!

 

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 和元生物成立于2013年,作为深耕细胞和基因治疗核心领域的高新技术企业,专注于为细胞和基因治疗的基础研究提供基因治疗载体研制、基因功能研究、药物靶点及药效研究等CRO服务,可提供①组学服务:常规转录组、单细胞转录组、基因组、代谢组及蛋白组等。②载体构建和病毒包装:质粒、siRNA、腺相关病毒(AAV)、腺病毒(ADV)、慢病毒(LVV)、逆转录病毒(RV)、单纯疱疹病毒(HSV)等病毒载体生产服务,提供R&D、实验室级别、GMP级别满足研发、小动物、大动物NHP到临床的不同研究阶段的使用需求。③细胞实验服务:过表达、干扰稳定株构建,单克隆细胞株构建服务及细胞功能学、药效学实验服务。④动物实验及机制研究:神经、代谢、肿瘤动物模型、药效药代、病理切片及蛋白、核酸检测服务。⑤特色项目服务:CRISPR文库筛选服务,外泌体整体研究服务,AAV衣壳筛选服务、听力研究整体项目服务,满足客户定制化或一站式项目服务,助力基础科学研究,促进基础研究到临床转化应用,推动细胞和基因治疗行业发展。

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