实操指南 | 箱线图怎么分析？

下限

通常延伸至最小值（或距下四分位数 1.5 倍四分位距的位置，超出部分为异常值）。

下四分位数（Q1）

数据中 25% 的数值小于该值。

中位数（Q2）

数据中 50% 的数值小于该值，反映数据的中心位置。

上四分位数（Q3）

数据中 75% 的数值小于该值。

上限

通常延伸至最大值（或距上四分位数 1.5 倍四分位距的位置，超出部分为异常值）。

四分位数

箱体的底部和顶部分别表示第一四分位数（Q1）和第三四分位数（Q3），箱体的长度代表四分位数间距（IQR），反映数据的分散程度。

①集中趋势差异

比较各组中位数的位置，若中位数差距大，可能存在组间中心位置差异。

②离散程度差异

箱线的高度（IQR）或须的长度反映数据分散程度，箱线越高说明数据越分散。

③分布形态差异

若一组数据的箱线偏上、另一组偏下，可能存在分布不对称的差异；异常值的数量和位置也能反映组间稳定性差异。

④显著性辅助判断

结合假设检验结果，箱线图可直观展示 “显著差异” 在实际数据中的表现。

①特殊参数

P 值展示形式：可选择数值，"*" 符号的数量，和不展示 P 值；

统计检验方法：自定义计算P值的方法；

检验组别：定义在哪些组别之间进行差异检验并标注P值，若为空则默认为数据文件第二列中所有组别。请输入两个以上在数据文件第二列中出现过的组别名称，每输入完成一次，通过回车或点击鼠标左键确定输入；

显示离群值：是否以散点的形式显示离群值，注意添加散点后无法显示离群值；

添加散点：将数值表示的点标明出来；

添加缺口：是否输出带凹口形式的箱线图；

散点大小：控制离群值和散点的大小；

分面按表格排序：规定了分面绘图（即数据文件中第三列的组别）的顺序是否按照组名称在数据文件中出现的先后顺序（或采用字母顺序排序）；

箱体宽度：控制箱体的宽度，含义为所占百分比；

添加误差线：在箱体两端添加横线；

误差线宽度：控制误差线的宽度。

②通用参数

标题：自定义绘图标题，支持中英文；

输出格式：选择输出文件的格式，其中pdf、svg、eps为矢量图格式，jpeg、png、tiff为位图格式，pptx可用于自主修改绘图中的文字、颜色等元素，plotly为html动态网页格式；

宽度、高度：定义绘图的长宽，若输出图形元素过于密集，则可适当调整该参数；

主题：可选择ggplot主题包ggthemes中提供的主题，美化绘图；

图例位置：自定义图例在绘图中的位置

图例方向：自定义图例中多个元素的排列方向

颜色画板：可选择ggsci包中提供的配色画板，适应不同的杂志要求。若需自定义配色，则可选择自定义。

自定义颜色画板：（高级选项）支持自定义颜色画板，请首先在颜色画板选项中选择自定义，并从下拉菜单中选择需要的颜色，若没有需要的颜色，也可以自己输入多个以＃开头的16进制颜色码。

和元生物提供多组学服务（如全外显子测序、转录组、Astral蛋白组、非靶向代谢组、非靶向脂质组、靶向代谢组、16s/ITS/18s扩增子测序、宏基因组、Cut&Tag、MeRIP (m6A)-seq、全基因组甲基化测序、简化甲基化测序等）和单细胞及空间转录组服务（如10x单细胞转录组、10x单细胞转录组及TCR/BCR、墨卓单细胞转录组、10x CytAssist空间转录组、10x HD空间转录组等），致力于为广大生命科学家、医学工作者提供基于多组学技术的科研及临床应用解决方案。