实操指南 | 功能富集柱形图，揭示潜在的生物学功能

功能注释与解读

将差异分子（如差异基因、差异蛋白）映射到已知的生物学功能（GO）、通路（KEGG、Reactome），揭示其潜在生物学机制。

假设生成

从数据驱动角度发现新的研究方向（如：差异基因富集在“DNA修复”通路，提示可研究该通路在疾病中的作用）。

降维与聚焦

成百上千的差异分子归纳为少数关键功能模块，避免“信息过载”。

跨组学整合

联合多组学数据（如转录组+蛋白组、转录组+代谢组、蛋白组+代谢组等），寻找共富集的功能或通路，揭示协同调控关系。

生物标志物筛选

筛选与特定表型（如耐药性、肿瘤转移）强相关的功能模块，辅助标志物发现。

①数据参数

X轴对应列：输入对应X轴的列名称，可依据上传数据选择“目标列（如差异基因数量Test）”。

Y轴对应列：输入对应Y轴的列名称，可依据上传数据选择“目标列（如GO/KEGG term名称）”。

颜色对应列：输入定义条目类型的列名称，可依据上传数据选择“目标列（如Category）”。

展示数目：定义每种类型所展示的条目数量，按照行号从小到大的顺序筛选.

②通用参数

标题：自定义绘图标题，支持中英文。

输出格式：选择输出文件的格式，如pdf、svg、ep、jpeg、png、tiff、pptx等。

宽度、高度：定义绘图的长宽，根据实际适当调整参数。

主题：可选择ggplot主题包ggthemes中提供的主题，美化绘图。

图例位置：自定义图例在绘图中的位置。

图例方向：自定义图例中多个元素的排列方向。

颜色画板：可选择ggsci包中提供的配色画板，适应不同的杂志要求。

自定义颜色画板：（高级选项）支持自定义颜色画板，请首先在颜色画板选项中选择自定义，并从下拉菜单中选择需要的颜色，若没有需要的颜色，也可以自己输入多个以＃开头的16进制颜色码。

标题大小：自定义标题字体大小。

图例标题大小：自定义图例标题字体大小。

图例文本大小：自定义图例文本字体大小。

坐标轴标题大小：自定义坐标轴标题字体大小。

坐标轴字体大小：自定义坐标轴文字字体大小。

X坐标轴文字角度：自定义X坐标轴文字角度。

X坐标轴水平调整：自定义X坐标轴文字水平位移，越大则越靠左。

X坐标轴垂直调整：自定义X坐标轴文字垂直位移，越大则越靠上。