如何绘制相关性热图？

按行或按列进行相关性计算；

右上（upper）表示显示右上角图形、左下（lower）表示显示左下角图形、全部（full）表示显示全部图形；

圆（circle）表示每个格子内的图形是圆圈、方（square）表示每个格子内的图形是正方形、椭圆、数字、阴影、颜色、饼图；

选择排序方法，如original、hclust、AOE、FPC、alphabet；

选择基因聚类的方法，如ward.D、ward.D2、single、complete、average、mcquitty、median、centroid；

选择计算相关性方法，如pearson、spearman、kendall；

选择热图中相关性值对应色块的颜色；

选择是否要显示相关性数值；

选择相关性数字大小，仅在展示数字时有用；

是否要绘制自相关的主对角线；

选择标注方法，可选择用符号、空白或P值标注不相关样本，也可以用*号标记相关样本。若想查看所有P值，可选择P值标注，并将显著水平设为负值。

标注类型为符号时，设置标记符号的种类，包括叉号、三角、圆圈等；

设置标记的颜色，如黑、红、绿、蓝、紫；

设置显著相关的P值的阈值，1为不相关，0为完全相关。当设置为标记不显著时只需输入一个数值。当设置为用*号标记显著时，可以输入从小到大的多个数值，代表*号的个数。

设置标记的大小。

选择输出文件的格式，其中pdf、svg、eps为矢量图格式，jpeg、png、tiff为位图格式，pptx可用于自主修改绘图中的文字、颜色等元素；

定义绘图的长宽，若输出图形元素过于密集，则可适当调整该参数；

控制绘图顶部标签文字的展示角度；

控制所有标签文字的大小，1表示不变，2表示变为2倍，0.5表示变为一半。